日军直接建立的慰安所相当普遍。日本第15师团第67联队联队长铃木在战后承认，根据日军的“惯例”，他命令在联队占领的五个地方（丰润、沙河镇等三个地方）建立慰安所，并抓获60名中国妇女担任“慰安妇”。
京都16师团福知山20联队的老兵(76岁)证明，他们联队的慰安所是在军队的指挥下经营的。“慰安妇”包括日本人和朝鲜人，一个慰安所大约有15人。士兵通常从白天到下午4点进入。从下午4点到晚上8点，是下士官(伍长、军曹、曹长)进入的时候了。8点以后是军官进入的时候了。军官没钱的话，做完事就回去，有钱的军官就可以留下来了。付满洲银行、朝鲜银行或日本银行的钱。1941年2月，开封日军第84野战队士兵户村英雄写道:“军队管理下的P屋(即慰安所)约有50栋房屋，这里住的女性大多是将军和下士官。一些人还将校长与这些“战时妻子”保持临时不负责任的关系。这些信息现存在吉林省档案馆。
在战争中建立的军事直营慰安所，依靠当地妇女的掠夺或强制征用，极其野蛮。1938年初，日军占领上海后不久，就逮捕了当地妇女，直接护送到北四川路虹口旅社(今四川北路)。门口有宪兵站岗，成为日军控制的慰安所。其实这就是1996年联合国人权调查委员会为日军慰安定义的“合法强奸中心”。有记录指出，1938年，日军位于北四川路横浜桥附近一家银行的“娱乐中心”。“房子的每一层都有非常温暖的水汀，最低的一层是日本士兵在无锡和浦东绑架的中国好妇女。自17岁或8岁以来，大约有数百人没有挂断电话，他们感到悲伤，而日本士兵则无休止地流动，任意选择性地满足他们。任何女人都有不从者，皮鞭立至”。
日军不仅建立了自己的慰安所，还命令和煽动日军和合作伙伴筹备慰安所。据武汉兵站司令部慰安妇部长(股长)山田清吉记载，兵站主任藤井源治中佐副官、高桥慰安部长强行接收汉口积庆68套房屋，让日本侨民设立12个慰安所，其他都是朝鲜人设立的慰安所。到1938年11月底，积庆里慰安所增加到30家；日本有130名“慰安妇”，朝鲜有150名“慰安妇”，共有280名。汉口慰安所的密度在日军占领区很少见。